El Inter volvería a revalidar la Copa de Italia venciendo de nuevo a la Roma en la final. Pese a ganar la liga el año 1995, el club no fue capaz de revalidar el título europeo tras sucumbir en la final de Roma ante la Juventus en los tiros desde el punto del penal. Si bien no ganaría la liga, el Inter ganó la Copa de Italia al vencer a la Roma en la final. Italia finalmente clasificó, pero Conte optó por no convocar a Pirlo a la Eurocopa y argumentó: «Cuando tomas la decisión de jugar en ciertas ligas, lo haces sabiendo que podrías pagar las consecuencias desde un punto de vista futbolístico».
El Inter es el segundo equipo más exitoso del fútbol italiano, con 30 títulos a nivel local (18 ligas, 7 copas y 5 supercopas), igualado con la Associazione Calcio Milan, siendo solo superado por la Juventus Football Club. Temporada de 1966/67 en Copa de Campeones Inter llegaría ala final enfrentando a Celtic en Lisboa perderia 2-1, en el campeonato local el Nerazzurri finalizaría segundo en la tabla de posiciones. El Inter de Milán ejerce de local en el Estadio Giuseppe Meazza (también conocido por su antiguo nombre, San Siro) desde 1947, y lo comparte con el AC Milan. El 4 de septiembre de 2006, falleció de cáncer el presidente del club de San Siro, Giacinto Facchetti.
Con Helenio Herrera de entrenador y grandes jugadores como Luis Suárez, Mario Corso, Giacinto Facchetti, Sandro Mazzola, Tarcisio Burgnich, Jair da Costa, Aristide Guarneri, Angelo Domenghini y su legendario capitán Armando Picchi. También cabe destacar que el club formó parte (como miembro fundador) de la Asociación de Clubes Europeos (antigua G-14), grupo compuesto por los catorce clubes más poderosos e influyentes tanto económica como deportivamente de Europa. Repite Brenner, el autor del primer tanto brasileño. En 1997 llegó el brasileño Ronaldo, en 1998 Roberto Baggio y en 1999 Christian Vieri, fichajes de relumbrón que batieron el récord de gastos en traspasos del equipo. Para la temporada 2004-05, el Inter firmaba a Roberto Mancini, un entrenador de 40 años que llegaba de entrenar al Lazio.
Una relativa estabilidad llegó en 1999 con el nuevo entrenador Marcello Lippi, que llegaba precisamente de triunfar en la Juventus. Según el ex entrenador Robert Vicot, el escudo, aunque reclamado por Daniel Hechter, fue creado por el entrenador amateur y diseñador profesional Sr. Vallot. Según The Times, el Chelsea sigue empeñado en fichar a Alex Sandro. Según la publicación inglesa el club de Manchester estaría preparando una oferta de 90 millones de libras (101.8 millones de euros) para llevarse al internacional belga. Eso sí, el BVB tiene ya asegurada una plaza en los treintaidosavos de la UEFA Europa League. Es uno de los clubes más ganadores y con mayor renombre históricamente de Italia, Europa y el mundo.
Fed Cup: Italia, Rusia, República Checa, Eslovaquia. Liderados por la dupla atacante Baggio-Zamorano (Ronaldo había sufrido una gravísima lesión), el Inter se clasificó para la UEFA Champions League y quedó subcampeón de la Copa de Italia. Fin de una era. Era el primer título de los interistas desde hacía 8 años. Otro símbolo de «Internazionale» era el escudo de armas de la antigua familia gobernante de Milán, los Visconti. El primer escudo de armas (con las iniciales FCIM) fue diseñado por Giogio Muggiani durante la mencionada reunión de fundación. Durante el transcurso de su tutela fue enviado a pruebas para el club Colo-Colo, no pudiendo ingresar debido a un esguince en su pie. Zamorano también dejó el club a mitad de temporada. Esa temporada sería recordada por encajar un 6-0 ante el Milan en el derbi y por los disturbios ocasionados por los fanes del Inter ante la mala situación del equipo.